Церковь Святителя Николая Чудотворца (в Будках) — одна из старейших церквей города Серпухов. 

Церковь построена в 1711 году на месте стоявшего здесь деревянного храма. В 1780—1788 — пристроен, а в 1850 году — расширен придел Святого великомученика и Победоносца Георгия, пристроена трапезная. Тогда же была полностью перестроена колокольня в стиле ампир. В 1838 году был перестроен алтарь.

В XVI в. Буткиной улицею назывался участок оживленной Боровской дороги (ныне ул. Чернышевского): въезд на высокий правый берег р. Нары. Имя улицы происходит, по-видимому, от глагола «бутить» — то есть мостить битым камнем. Видимо, этот трудный подъём-спуск стал первой в нашем городе мостовой — и всех, одолевших крутизну его, наверху встречает церковь Святителя Николая — покровителя путников. Храм этот имел особое прозвание: “Никола-в-Будках”.

В советское время (в 1930-е) храм закрыт и частично разрушен (уничтожены колокольня и главки). Служивший в нём иеромонах Андрей (Андрей Семёнович Алексеев, родился в 1872 году) был арестован 2 октября 1937 года и 21 октября расстрелян на Бутовском полигоне под Москвой.В конце 1930-40-х гг. здание храма занимал городской и районный архив.

С 1999 г. храм Николы-в-Бутках возвращён Русской Православной Церкви.