Монастырь в деревне Колычёво был основан иеросхимонахом Макарием (Петровым) рядом с местом, где в 1800 году была найдена икона Божией Матери именуемая "Казанской". 

Людская молва рассказывает, что крестьянин из этой деревни пошёл за водой, путь его пролегал через густой лес и на одном из деревьев он увидел чудесным образом явленную икону. Крестьянин икону снял с ветки и поставил рядом с колодцем, а сам поспешил в деревню, рассказать об этом. На том необычном месте поставили колычёвцы деревянную часовню и купель. 

В 1864 году пришёл сюда из коломенского Бобренева монастыря прозорливый старец - иеросхимонах Макарий. На средства благодарных почитателей старец приобрёл находившееся в версте от места чудесного явления Казанской иконы Божией Матери старое дворянское имение с принадлежавшей ему землёй. 

Как благословение от бывшей хозяйки имения помещицы М.П. Брукендаль, отец Макарий получил в дар Святой Казанский образ Богоматери. Решил он на этом месте основать женскую богадельню. 

Открытая Макарием богадельня для призрения вдов и сирот постепенно преобразовалась в женскую общину, во главе которой встала вдова титулярного советника Мария Памфиловна Степанова, ставшая впоследствии первой игуменьей обители. 25 мая 1875 года явилось днём основания общины, а в декабре 1885 года она была преобразована в монастырь.

14 июня 1881 года был заложен первый камень в главный собор будущего монастыря - Казанский, завершение строительства и освещение которого произошло в 1888 году.

Центрический четырехстолпный Казанский храм в псевдорусском стиле сооружен в 1881–1897 гг. Боковые приделы – Успенский и Никольско-Митрофаниевский.

Был закрыт не позже 1930-х гг., венчания сломаны.

Возвращен Церкви в 2003 г. и в настоящее время в нем проводятся реставрационные работы. Богослужения не совершаются.